Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RBX1P62877 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBX1P62877 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBX1P62877 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RBX1P62877 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RBX1P62877 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RBX1P62877 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RBX1P62877 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms