Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VBP1P61758 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VBP1P61758 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VBP1P61758 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VBP1P61758 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VBP1P61758 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VBP1P61758 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VBP1P61758 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VBP1P61758 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VBP1P61758 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms