Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK11-1P61568 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVK11-1P61568 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms