Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX17P56962 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX17P56962 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX17P56962 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX17P56962 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX17P56962 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX17P56962 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
STX17P56962 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms