Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFAP3P55082 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFAP3P55082 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms