Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHB3P54753 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EPHB3P54753 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms