Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTDSS1P48651 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTDSS1P48651 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms