Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MAGEA1P43355 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAGEA1P43355 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms