Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP8P40818 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP8P40818 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP8P40818 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP8P40818 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP8P40818 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP8P40818 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP8P40818 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP8P40818 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms