Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
IGHMBP2P38935 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IGHMBP2P38935 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGHMBP2P38935 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGHMBP2P38935 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms