Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TRIM23P36406 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TRIM23P36406 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms