Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT4P35916 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT4P35916 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT4P35916 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT4P35916 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FLT4P35916 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FLT4P35916 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT4P35916 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT4P35916 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FLT4P35916 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FLT4P35916 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FLT4P35916 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FLT4P35916 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FLT4P35916 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FLT4P35916 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms