Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPA3P35244 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPA3P35244 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPA3P35244 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms