Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CTNNA1P35221 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms