Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms