Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
BRS3P32247 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
BRS3P32247 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
BRS3P32247 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BRS3P32247 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms