Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHMLP26374 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMLP26374 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHMLP26374 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHMLP26374 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHMLP26374 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHMLP26374 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHMLP26374 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHMLP26374 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHMLP26374 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms