Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRKCHP24723 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKCHP24723 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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