Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KDELR1P24390 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms