Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCN1P20061 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCN1P20061 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCN1P20061 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCN1P20061 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TCN1P20061 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TCN1P20061 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TCN1P20061 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TCN1P20061 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms