Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZNF3P17036 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZNF3P17036 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms