Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGA4P13612 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms