Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PYGBP11216 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PYGBP11216 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PYGBP11216 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PYGBP11216 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PYGBP11216 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PYGBP11216 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PYGBP11216 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PYGBP11216 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PYGBP11216 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PYGBP11216 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms