Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HSP90AB1P08238 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HSP90AB1P08238 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HSP90AB1P08238 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms