Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPN1P04843 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPN1P04843 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPN1P04843 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPN1P04843 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RPN1P04843 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPN1P04843 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPN1P04843 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms