Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PEX11BO96011 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PEX11BO96011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms