Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB6O95452 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB6O95452 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB6O95452 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB6O95452 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB6O95452 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB6O95452 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB6O95452 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GJB6O95452 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GJB6O95452 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms