Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPFIA4O75335 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPFIA4O75335 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms