Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB11FIP3O75154 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB11FIP3O75154 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms