Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LANCL1O43813 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LANCL1O43813 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms