Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HOXA3O43365 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms