Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD3O43242 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD3O43242 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD3O43242 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD3O43242 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD3O43242 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMD3O43242 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms