Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MEFVO15553 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MEFVO15553 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MEFVO15553 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MEFVO15553 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MEFVO15553 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms