Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPN9O14815 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPN9O14815 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms