Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 REST-203ENST00000511065 513 ntTSL 1 (best)25.98■■□□□ 1.754e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-207ENST00000598127 558 ntTSL 221.54■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-10■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LMO4-204ENST00000495705 565 ntTSL 320.88■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 IGFLR1-204ENST00000588018 1148 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.851e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.834e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-210ENST00000495778 653 ntTSL 220.04■□□□□ 0.84e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-202ENST00000440963 575 ntTSL 219.96■□□□□ 0.794e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-203ENST00000458117 782 ntTSL 219.5■□□□□ 0.714e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.671e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-212ENST00000554625 447 ntTSL 318.89■□□□□ 0.614e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.61e-7■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.561e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 UFM1-204ENST00000464423 585 ntTSL 318.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.484e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 IGFLR1-208ENST00000591748 329 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.33■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACP6-210ENST00000620634 885 ntTSL 1 (best)17.23■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-213ENST00000557560 611 ntTSL 416.94■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-209ENST00000554754 562 ntTSL 316.88■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-208ENST00000489117 770 ntTSL 316.17■□□□□ 0.184e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 IGFLR1-210ENST00000592693 593 ntTSL 315.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LUZP1-204ENST00000471849 1190 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-206ENST00000597365 606 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-202ENST00000416728 1383 ntTSL 214.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 ASNSD1-204ENST00000605941 573 ntTSL 414.18□□□□□ -0.141e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TESK2-202ENST00000372086 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.174e-14■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LMO4-203ENST00000489303 952 ntTSL 213.82□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TESK2-203ENST00000486676 3019 ntTSL 513.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-9■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SLC25A42-205ENST00000600251 414 ntTSL 313.62□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-14■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TSEN54-210ENST00000583634 282 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PAF1-205ENST00000595797 760 ntTSL 312.42□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LUZP1-201ENST00000302291 8898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 PLGRKT-204ENST00000482696 592 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ACP6-204ENST00000493129 543 ntTSL 511.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 RIC8A-212ENST00000530149 3417 nt10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.741e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-202ENST00000420250 2172 ntTSL 510.38□□□□□ -0.751e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-201ENST00000260952 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 C1orf198-202ENST00000427697 3666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.764e-9■■■■■ 37.2
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DDX3XO00571 ASNSD1-207ENST00000607535 579 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.91e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 RIC8A-206ENST00000527039 675 ntTSL 29.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SDHC-206ENST00000470743 832 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-8■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-204ENST00000553156 570 ntTSL 48.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-203ENST00000425590 567 ntTSL 28.13□□□□□ -1.111e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-205ENST00000606910 741 ntTSL 38.07□□□□□ -1.121e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.132e-26■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LUZP1-202ENST00000314174 3715 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-211ENST00000555491 619 ntTSL 37.65□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.211e-20■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 UFM1-205ENST00000494372 777 ntTSL 27.49□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.261e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 57.14□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.291e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-10■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.432e-26■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.432e-10■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.532e-26■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.572e-26■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 JKAMP-210ENST00000554795 856 ntTSL 54.38□□□□□ -1.711e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.821e-7■■■■■ 37.2
DDX3XO00571 PCBD1-202ENST00000493228 732 ntTSL 214.52□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 CDIP1-211ENST00000586768 548 ntTSL 411.66□□□□□ -0.545e-27■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 M6PR-211ENST00000543845 596 ntTSL 317.11■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 M6PR-213ENST00000544245 660 ntTSL 216.24■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 37.1
DDX3XO00571 M6PR-206ENST00000541507 2198 ntTSL 515.21■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 37.1
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