Protein–RNA interactions for Protein: O00570

SOX1, Transcription factor SOX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX1O00570 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX1O00570 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX1O00570 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX1O00570 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX1O00570 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX1O00570 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX1O00570 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX1O00570 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX1O00570 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms