Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP17L11C9JVI0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L11C9JVI0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L11C9JVI0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L11C9JVI0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L11C9JVI0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L11C9JVI0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms