Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP17L5A8MUK1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP17L5A8MUK1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms