Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GOLGA6BA6NDN3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6BA6NDN3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms