Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMNCA6NCL1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GMNCA6NCL1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms