Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
A0A0U1RQF3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A0U1RQF3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms