Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.186e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.286e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.286e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 212.27□□□□□ -0.456e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 212.27□□□□□ -0.456e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.456e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 27.7□□□□□ -1.186e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-202ENST00000553981 285 ntTSL 35.29□□□□□ -1.566e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-208ENST00000556956 450 ntTSL 24.28□□□□□ -1.726e-11■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 517.82■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 METAP2-207ENST00000549502 513 ntTSL 47.27□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.722e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-225ENST00000473680 1232 ntTSL 223.03■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-221ENST00000466074 1564 ntTSL 222.13■■□□□ 1.132e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-208ENST00000422811 771 ntTSL 321.03■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-224ENST00000472324 2143 ntTSL 1 (best)19.08■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-222ENST00000466638 1204 ntTSL 217.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-232ENST00000489536 836 ntTSL 215.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-214ENST00000439087 754 ntTSL 515.43■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-211ENST00000433470 717 ntTSL 514.81□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 PNCK-205ENST00000411968 557 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-231ENST00000557336 580 ntTSL 311.81□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 511.33□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 510.71□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 510.32□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 310.18□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 59.53□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 37.93□□□□□ -1.143e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-207ENST00000485687 587 ntTSL 310.97□□□□□ -0.657e-8■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D23-203ENST00000471098 559 ntTSL 47.49□□□□□ -1.217e-8■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-202ENST00000593637 1043 ntTSL 323.31■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-209ENST00000596953 1043 ntTSL 223.31■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-210ENST00000597607 1164 ntTSL 317.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.376e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-216ENST00000598987 1202 ntTSL 215.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-211ENST00000598298 868 ntTSL 513.82□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 TECR-212ENST00000598333 822 ntTSL 310.82□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 REXO5-212ENST00000566993 2549 ntTSL 515.52■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 REXO5-203ENST00000561474 617 ntTSL 57.39□□□□□ -1.233e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 511.58□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 EPRS-204ENST00000477030 1526 ntTSL 1 (best)21.85■■□□□ 1.093e-6■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 AC005381.1-203ENST00000591920 569 ntTSL 513.57□□□□□ -0.247e-7■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 AC005381.1-204ENST00000585697 599 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 AC005381.1-202ENST00000592716 574 ntTSL 56.79□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.532e-6■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 516.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 34.7
UTP3Q9NQZ2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.933e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 KIF22-209ENST00000569636 834 ntTSL 517.06■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.23e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 KIF22-210ENST00000570173 562 ntTSL 512.94□□□□□ -0.343e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.933e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.673e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 MFGE8-208ENST00000558773 534 ntTSL 321.18■□□□□ 0.982e-15■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-217ENST00000567589 550 ntTSL 321.11■□□□□ 0.973e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 MFGE8-204ENST00000557944 435 ntTSL 221.08■□□□□ 0.972e-15■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 NAA10-213ENST00000478177 573 ntTSL 1 (best)20.28■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 TOP1MT-207ENST00000519139 1561 ntTSL 520.02■□□□□ 0.83e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 NAA10-216ENST00000488481 569 ntTSL 219.42■□□□□ 0.73e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 MFGE8-207ENST00000558352 1031 ntTSL 218.61■□□□□ 0.572e-15■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-203ENST00000477828 892 ntTSL 518.14■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ANP32A-211ENST00000561430 508 ntTSL 217.91■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 NGRN-201ENST00000331497 2784 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.243e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ANP32A-204ENST00000480858 352 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 AKT1-213ENST00000555458 705 ntTSL 214.83□□□□□ -0.043e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 AKT1-219ENST00000610370 3187 ntTSL 214.66□□□□□ -0.063e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 NGRN-202ENST00000379095 7237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 AC091167.7-201ENST00000622269 518 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-205ENST00000489308 794 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-204ENST00000484036 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 TOP1MT-214ENST00000522041 906 ntTSL 311.31□□□□□ -0.63e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ANKRD13D-203ENST00000504186 564 ntTSL 410.88□□□□□ -0.673e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-207ENST00000526132 567 ntTSL 410.26□□□□□ -0.773e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 59.92□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-202ENST00000472944 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.953e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 NGRN-203ENST00000411845 388 ntTSL 38.97□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 BTF3L4-208ENST00000533836 568 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 USP9X-204ENST00000463829 666 ntTSL 37.78□□□□□ -1.163e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.673e-9■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.425e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 ZC3H11A-212ENST00000495527 8404 ntTSL 1 (best)6.09□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 MAP2K2-211ENST00000602167 431 ntTSL 516.3■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 34.6
UTP3Q9NQZ2 SETD5-215ENST00000464410 593 ntTSL 49.24□□□□□ -0.934e-14■■■■■ 34.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3668.4 ms