RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612928.1

5S_rRNA.16-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.87□□□□□ -0.99
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HRCP23327 699 aa7.6□□□□□ -1.19
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.49□□□□□ -1.21
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.49□□□□□ -1.21
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CHIC1Q5VXU3 224 aa7.48□□□□□ -1.21
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.45□□□□□ -1.22
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.43□□□□□ -1.22
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PCGF6Q9BYE7 350 aa7.35□□□□□ -1.23
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.19□□□□□ -1.26
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCC9O60706 1549 aa7.12□□□□□ -1.27
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.07□□□□□ -1.28
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.05□□□□□ -1.28
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MYT1Q01538 1121 aa7.04□□□□□ -1.28
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TRIM41Q8WV44 630 aa7.01□□□□□ -1.29
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NEUROD1Q13562 356 aa6.9□□□□□ -1.3
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SCRIBQ14160 1630 aa6.9□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 NACADO15069 1562 aa6.87□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.86□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.84□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.84□□□□□ -1.31
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.82□□□□□ -1.32
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WIZO95785 1651 aa6.81□□□□□ -1.32
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EEA1Q15075 1411 aa6.81□□□□□ -1.32
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CEP162Q5TB80 1403 aa6.76□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.75□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.73□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.72□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMARCA2P51531 1590 aa6.72□□□□□ -1.33
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 GOLGA3Q08378 1498 aa6.71□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SMARCA4P51532 1647 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SOGA1O94964 1423 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MIER1Q8N108 512 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ABCC8Q09428 1581 aa6.69□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIF21BO75037 1637 aa6.68□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.65□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.65□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.64□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.63□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CLIP1P30622 1438 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CUX2O14529 1486 aa6.59□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SYNJ1O43426 1573 aa6.57□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERICH3Q5RHP9 1530 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 APLP2Q06481 763 aa6.53□□□□□ -1.36
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TOP2BQ02880 1626 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PRXQ9BXM0 1461 aa6.52□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa6.5□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.5□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARAP1Q96P48 1450 aa6.5□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAP3K1Q13233 1512 aa6.49□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.47□□□□□ -1.37
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCNB3Q8WWL7 1395 aa6.45□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CCER2I3L3R5 266 aa6.45□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 MAPKBP1O60336 1514 aa6.44□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.41□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KIF27Q86VH2 1401 aa6.41□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.41□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa6.41□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 BCL11AQ9H165 835 aa6.4□□□□□ -1.38
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa6.4□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 KCNH8Q96L42 1107 aa6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 CUX1P39880 1505 aa6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 TIAM1Q13009 1591 aa6.38□□□□□ -1.39
5S_rRNA.16-201ENST00000612928 WDR97A6NE52 1622 aa6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms