RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.13■■■■■ 5.62
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.88■■■■■ 4.78
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC9O60706 1549 aa44.68■■■■■ 4.74
MFGE8-208ENST00000558773 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.63■■■■■ 4.41
MFGE8-208ENST00000558773 NACADO15069 1562 aa42.41■■■■■ 4.38
MFGE8-208ENST00000558773 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.16■■■■■ 4.34
MFGE8-208ENST00000558773 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.94■■■■■ 4.3
MFGE8-208ENST00000558773 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.84■■■■■ 4.29
MFGE8-208ENST00000558773 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.66■■■■■ 4.26
MFGE8-208ENST00000558773 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
MFGE8-208ENST00000558773 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
MFGE8-208ENST00000558773 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.45■■■■■ 4.23
MFGE8-208ENST00000558773 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.42■■■■■ 4.22
MFGE8-208ENST00000558773 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.89■■■■■ 4.14
MFGE8-208ENST00000558773 SCRIBQ14160 1630 aa40.85■■■■■ 4.13
MFGE8-208ENST00000558773 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.39■■■■■ 4.06
MFGE8-208ENST00000558773 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
MFGE8-208ENST00000558773 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.24■■■■■ 4.03
MFGE8-208ENST00000558773 NCAPD3P42695 1498 aa39.18■■■■□ 3.86
MFGE8-208ENST00000558773 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.06■■■■□ 3.84
MFGE8-208ENST00000558773 SMARCA4P51532 1647 aa39.03■■■■□ 3.84
MFGE8-208ENST00000558773 SMARCA2P51531 1590 aa38.94■■■■□ 3.82
MFGE8-208ENST00000558773 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
MFGE8-208ENST00000558773 HMGXB3Q12766 1538 aa38.86■■■■□ 3.81
MFGE8-208ENST00000558773 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.7■■■■□ 3.79
MFGE8-208ENST00000558773 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
MFGE8-208ENST00000558773 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.61■■■■□ 3.77
MFGE8-208ENST00000558773 ERCC6Q03468 1493 aa38.53■■■■□ 3.76
MFGE8-208ENST00000558773 CUX2O14529 1486 aa38.47■■■■□ 3.75
MFGE8-208ENST00000558773 NESP48681 1621 aa38.45■■■■□ 3.75
MFGE8-208ENST00000558773 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.28■■■■□ 3.72
MFGE8-208ENST00000558773 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.23■■■■□ 3.71
MFGE8-208ENST00000558773 WIZO95785 1651 aa38.14■■■■□ 3.7
MFGE8-208ENST00000558773 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
MFGE8-208ENST00000558773 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38■■■■□ 3.67
MFGE8-208ENST00000558773 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.98■■■■□ 3.67
MFGE8-208ENST00000558773 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.93■■■■□ 3.66
MFGE8-208ENST00000558773 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
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MFGE8-208ENST00000558773 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.64■■■■□ 3.62
MFGE8-208ENST00000558773 CFTRP13569 1480 aa37.58■■■■□ 3.61
MFGE8-208ENST00000558773 WDR62O43379 1518 aa37.56■■■■□ 3.6
MFGE8-208ENST00000558773 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.52■■■■□ 3.6
MFGE8-208ENST00000558773 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.52■■■■□ 3.6
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.28■■■■□ 3.56
MFGE8-208ENST00000558773 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
MFGE8-208ENST00000558773 PRDM2Q13029 1718 aa37.16■■■■□ 3.54
MFGE8-208ENST00000558773 TOPBP1Q92547 1522 aa36.83■■■■□ 3.49
MFGE8-208ENST00000558773 ABCC8Q09428 1581 aa36.79■■■■□ 3.48
MFGE8-208ENST00000558773 IFT140Q96RY7 1462 aa36.79■■■■□ 3.48
MFGE8-208ENST00000558773 OSCARQ8IYS5 282 aa36.76■■■■□ 3.48
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
MFGE8-208ENST00000558773 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.7■■■■□ 3.47
MFGE8-208ENST00000558773 TRIM41Q8WV44 630 aa36.57■■■■□ 3.44
MFGE8-208ENST00000558773 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
MFGE8-208ENST00000558773 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
MFGE8-208ENST00000558773 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
MFGE8-208ENST00000558773 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.41■■■■□ 3.42
MFGE8-208ENST00000558773 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.32■■■■□ 3.41
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MFGE8-208ENST00000558773 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.25■■■■□ 3.39
MFGE8-208ENST00000558773 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.22■■■■□ 3.39
MFGE8-208ENST00000558773 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.22■■■■□ 3.39
MFGE8-208ENST00000558773 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.22■■■■□ 3.39
MFGE8-208ENST00000558773 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
MFGE8-208ENST00000558773 CHD1O14646 1710 aa36.17■■■■□ 3.38
MFGE8-208ENST00000558773 WDR97A6NE52 1622 aa36.15■■■■□ 3.38
MFGE8-208ENST00000558773 ARHGEF11O15085 1522 aa36.13■■■■□ 3.37
MFGE8-208ENST00000558773 FBLN2P98095 1184 aa36.08■■■■□ 3.37
MFGE8-208ENST00000558773 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.01■■■■□ 3.36
MFGE8-208ENST00000558773 GRIN2BQ13224 1484 aa35.97■■■■□ 3.35
MFGE8-208ENST00000558773 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
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MFGE8-208ENST00000558773 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
MFGE8-208ENST00000558773 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.86■■■■□ 3.33
MFGE8-208ENST00000558773 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.86■■■■□ 3.33
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MFGE8-208ENST00000558773 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.82■■■■□ 3.32
MFGE8-208ENST00000558773 PBRM1Q86U86 1689 aa35.8■■■■□ 3.32
MFGE8-208ENST00000558773 ARAP1Q96P48 1450 aa35.8■■■■□ 3.32
MFGE8-208ENST00000558773 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.79■■■■□ 3.32
MFGE8-208ENST00000558773 SYNJ1O43426 1573 aa35.77■■■■□ 3.32
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MFGE8-208ENST00000558773 TOP2BQ02880 1626 aa35.73■■■■□ 3.31
MFGE8-208ENST00000558773 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.73■■■■□ 3.31
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MFGE8-208ENST00000558773 ADAMTS12P58397 1594 aa35.49■■■■□ 3.27
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MFGE8-208ENST00000558773 NUP160Q12769 1436 aa35.4■■■■□ 3.26
MFGE8-208ENST00000558773 CEP170Q5SW79 1584 aa35.36■■■■□ 3.25
MFGE8-208ENST00000558773 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
MFGE8-208ENST00000558773 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.25■■■■□ 3.23
MFGE8-208ENST00000558773 SHROOM2Q13796 1616 aa35.22■■■■□ 3.23
MFGE8-208ENST00000558773 IGF1RP08069 1367 aa35.05■■■■□ 3.2
MFGE8-208ENST00000558773 JPH4Q96JJ6 628 aa35.05■■■■□ 3.2
MFGE8-208ENST00000558773 KIF27Q86VH2 1401 aa35.03■■■■□ 3.2
MFGE8-208ENST00000558773 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
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