Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYQ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYQ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYQ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYQ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYQ6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYQ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYQ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
V9GYQ6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms