Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REXO2Q9Y3B8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REXO2Q9Y3B8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms