Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRG3Q9Y2Y8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms