Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG6Q9Y2V7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG6Q9Y2V7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms