Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RCE1Q9Y256 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RCE1Q9Y256 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms