Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA3Q9XRX5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HHLA3Q9XRX5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms